Изменчивость ядерных микросателлитных локусов в популяциях кедрового стланика (italicPinus pumila/italic (Pallas) Regel) из российской части ареала : научное издание

Описание

Тип публикации: статья из журнала

Год издания: 2017

Идентификатор DOI: 10.7868/S0016675817020084

Аннотация: Проведен анализ изменчивости ядерных микросателлитных локусов у кедрового стланика. Шесть микросателлитных локусов (RPS2, RPS6, RPS12, RPS124, RPS127, Pc18) демонстрируют различный уровень полиморфизма в 10 популяциях кедрового стланика: среднее число аллелей на локус составило 4.88, средняя наблюдаемая гетерозиготность – 0.465, срПоказать полностьюедняя ожидаемая гетерозиготность – 0.510. Около 13% общей генетической изменчивости объясняется генетическими различиями между популяциями (FST = 0.129). Генетические расстояния между изученными популяциями Pinus pumila, основанные на частотах SSR-маркеров, достоверно коррелировали с географическими расстояниями между выборками. Уровень генетической изменчивости популяций с п-ова Камчатка был ниже по сравнению с материковыми и островными популяциями. Установленная в нашем исследовании генетическая разобщенность камчатско-магаданских и остальных популяций стланика может объясняться их формированием из разных плейстоценовых рефугиумных центров. Variability of nuclear microsatellite loci was examined in Siberian dwarf pine. Six microsatellite loci (RPS2, RPS6, RPS12, RPS124, RPS127, Pc18) demonstrated different polymorphism levels in ten populations of Siberian dwarf pine. The average number of alleles per locus was 4.88, the average observed heterozygosity was 0.465, and the average expected heterozygosity was 0.510. About 13% of total genetic variability was explained by the genetic differences between the populations (FST = 0.129). Genetic distances between the examined populations of Pinus pumila inferred from the data on the SSR marker frequencies statistically significantly correlated with the geographical distances between the population samples. The level of genetic variability of the populations from Kamchatka Peninsula was lower than that demonstrated by continental and island populations. The genetic differentiation of the Kamchatka–Magadan and other populations of Siberian dwarf pine observed in our study can be explained in terms of their formation from different Pleistocene refugial centers. English translation of the paper published in Russian Journal of Genetics, 2017, Vol. 53, No. 3, is available ONLINE by subscription from: http://www.springer.com/, http://link.springer.com/journal/ 11177. Keywords: molecular genetic markers, polymorphism, population structure and differentiation, genetic distance.

Ссылки на полный текст

Издание

Журнал: Генетика

Выпуск журнала: Т. 53, 3

Номера страниц: 324-333

ISSN журнала: 00166758

Место издания: Москва

Издатель: Российская академия наук

Персоны

  • Орешкова Н.В. (Институт леса им. В.Н. Сукачева Сибирского отделения Российской академии наук, Красноярск 660036)
  • Ветрова В.П. (Камчатский филиал Тихоокеанского института географии Дальневосточного отделения Российской академии наук, Петропавловск-Камчатский 683024)
  • Горошкевич С.Н. (Институт мониторинга климатических и экологических систем Сибирского отделения Российской академии наук, Томск 634055)
  • Петрова Е.А. (Институт мониторинга климатических и экологических систем Сибирского отделения Российской академии наук, Томск 634055)

Вхождение в базы данных